BibTeX, biblatex and biberSome of my sources are showing up as question marks

Information and discussion about BiBTeX - the bibliography tool for LaTeX documents.
Post Reply
ST26AAUDK
Posts: 3
Joined: Fri Mar 11, 2022 11:40 am

Some of my sources are showing up as question marks

Post by ST26AAUDK »

I'm working on a project and some of my sources are showing up as question marks. I can't figure out what the problem is. I've tried copying the format of the sources that work, inputting different information, and calling them something else, but they then show up as question marks. It seems to be random for me.

The setup for our document is below. It was copied from a different project where these problems didn't present themselves.

Code: Select all

\documentclass[a4paper,11pt,oneside]{memoir}

\setcounter{secnumdepth}{2}
\setcounter{tocdepth}{2}

\usepackage[danish]{babel}
\usepackage{graphicx,float,xcolor}
\usepackage{amsmath,amssymb}
\usepackage{hyperref}
%\usepackage[colorlinks]{hyperref}
\usepackage[shortlabels]{enumitem}
\usepackage{siunitx}
\usepackage{wrapfig}
\usepackage{multicol}
\usepackage{textalpha}
\usepackage{appendix}
\hypersetup{colorlinks,%
linkcolor=black,%
citecolor=black,%
}
\sisetup{output-decimal-marker = {,}}

% ¤¤ Marginer ¤¤ %
\setlrmarginsandblock{2.5cm}{2.5cm}{*}		% \setlrmarginsandblock{Indbinding}{Kant}{Ratio}
\setulmarginsandblock{2.5cm}{3.0cm}{*}		% \setulmarginsandblock{Top}{Bund}{Ratio}
\checkandfixthelayout 						% Oversaetter vaerdier til brug for andre pakker

%	¤¤ Afsnitsformatering ¤¤ %
\setlength{\parindent}{0mm}           		% Stoerrelse af indryk
\setlength{\parskip}{3mm}          			% Afstand mellem afsnit ved brug af double Enter
\linespread{1,5}							% Linie afstand

\chapterstyle{verville}
\pagestyle{plain}
\bibliographystyle{unsrt}
\setlength{\parindent}{0pt}
\setlength{\parskip}{\baselineskip}
\setsecnumdepth{subsection}

\begin{document}
\include{Forside}\thispagestyle{empty}
\include{efterforside}\thispagestyle{empty}
\include{Abstrakt}\thispagestyle{empty}
\include{Forord}\thispagestyle{empty}
\addtocontents{toc}{\protect\thispagestyle{empty}}\tableofcontents*\thispagestyle{empty}
\clearpage
\setcounter{page}{1}
\include{Problemanalyse/Centralnervesystemet}
\include{Problemanalyse/Skader på Centralnervesystemet}
\include{Problemanalyse/Lammelse}

\bibliography{Bib.bib}
%%%% Kilder %%%%
	%\bibliography{Bibliografi.bib}							% Litteraturlisten 
\end{document}
Three of the sources in the .bib file are below. The first two work, the third one doesn't. I even copied the format of the second source to make the third, but it still comes out as a question mark. There are more sources than just these three, where one other is working and the rest aren't.

Code: Select all

@book{feher2017quantitative,
  title = {Quantitative Human Physiology: An Introduction},
  author = {Feher, J.J.},
  isbn = {9780128011546},
  series = {Biomedical Engineering},
  url = {https://books.google.dk/books?id=8ALSBgAAQBAJ},
  year = {2017},
  publisher = {Elsevier Science},
}
@misc{Rygmarv,
author = {Michaela Harrow-Mortelliti, Vamsi Reddy,  George Jimsheleishvili.},
  title = {Physiology, Spinal Cord},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK544267/}},
  note= {Accessed 2 Mar 2022},
}
@misc{Fakta,
author = {Rigshospitalet},
  title = {Fakta om rygmarvsskade},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.rigshospitalet.dk/afdelinger-og-klinikker/neuro/rygmarvsskader/undersogelse-og-behandling/Sider/fakta-om-rygmarvsskade.aspx}},
  note= {Accessed 1 Mar 2022},
}
Last edited by Stefan Kottwitz on Fri Mar 11, 2022 1:32 pm, edited 1 time in total.
Reason: code marked

Recommended reading 2024:

LaTeXguide.org • LaTeX-Cookbook.net • TikZ.org

NEW: TikZ book now 40% off at Amazon.com for a short time.

Stefan Kottwitz
Site Admin
Posts: 10348
Joined: Mon Mar 10, 2008 9:44 pm

Some of my sources are showing up as question marks

Post by Stefan Kottwitz »

Hi,

welcome to the forum!

That bibliography works fine, with all three entries. See:

Code: Select all

\documentclass[a4paper,11pt,oneside]{memoir}
\begin{filecontents}[force]{Bib.bib}
@book{feher2017quantitative,
  title = {Quantitative Human Physiology: An Introduction},
  author = {Feher, J.J.},
  isbn = {9780128011546},
  series = {Biomedical Engineering},
  url = {https://books.google.dk/books?id=8ALSBgAAQBAJ},
  year = {2017},
  publisher = {Elsevier Science},
}
@misc{Rygmarv,
author = {Michaela Harrow-Mortelliti, Vamsi Reddy,  George Jimsheleishvili.},
  title = {Physiology, Spinal Cord},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK544267/}},
  note= {Accessed 2 Mar 2022},
}
@misc{Fakta,
author = {Rigshospitalet},
  title = {Fakta om rygmarvsskade},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.rigshospitalet.dk/afdelinger-og-klinikker/neuro/rygmarvsskader/undersogelse-og-behandling/Sider/fakta-om-rygmarvsskade.aspx}},
  note= {Accessed 1 Mar 2022},
}
\end{filecontents}
\usepackage{hyperref}
\bibliographystyle{unsrt}
\begin{document}
See \cite{feher2017quantitative}, \cite{Rygmarv}, and \cite{Fakta}.
\bibliography{Bib.bib}
\end{document}
Your code example above cannot be tested because it includes your chapter files that we don't have, so we cannot compile it. Furthermore it doesn't have any \cite command, so it basically does nothing to show the issue.

It would be great if you would provide code that can be tested and that shows the issue with the question mark.

Stefan
LaTeX.org admin
ST26AAUDK
Posts: 3
Joined: Fri Mar 11, 2022 11:40 am

Some of my sources are showing up as question marks

Post by ST26AAUDK »

Thank you for getting back to me. Included below is one of the documents that is included in the master posted above. Note in the second to last paragraph there are several sources that were posted to test. When compiled in Overleaf they appear as follows: [?] [1] [?] [?][?] [2] [?]. In addition, the entire bibliography is posted below.

Code: Select all

\chapter{Skader på Centralnervesystemet}

\section{Rygmarvsskade der medfører lammelse}
Som beskrevet tidligere består rygsøjlen af 33 knoglehvirvler, men i forhold til en rygmarvsskade er der fokus på de øverste 24 knoglehvirvler. Disse knoglehvirvler udgør en sund og rask rygsøjle. De øverste 24 knoglehvirvler inddeles altså i nakke-, bryst- og lændehvirvlerne. Disse knoglehvirvler fungerer også som en beskyttelse for nervebanerne der løber fra hjernen og igennem rygmarven. En rygmarvsskade er en eller flere skader på disse nerver i rygmarvskanalen, som er grundelementet for forbindelser og signaler mellem hjerne og krop. 

Hvis en rygmarvsskade sker på nakkehvirvlerne, altså på en eller flere af C1-C7-hvirvlerne, vil det medføre total lammelse i kroppen. Dog vil der være få bevaret motoriske funktioner, såsom øje- og talefunktion. 
En total lammelse rammer ikke patientens psykiske hjernefunktion. Det betyder altså, at lammelsen kun går ud over de motoriske evner i kroppen. I værste tilfælde kan en total lammelse også ramme hals- og talefunktionen, så patienten kun kan bevæge øjnene. 

Hvis en rygmarvsskade finder sted på brysthvirvlerne, altså på en eller flere af T1-T12-hvirvlerne vil det medføre lammelse fra brystet og ned. Det kan ske, at lammelsen også sker i armene eller dele af armene, men der findes ingen konkret skabelon over, hvordan lammelser i kroppen forløber. Sker rygmarsskaden derimod på lændehvirvlerne, altså på en eller flere af L1-L5-hvirvlerne vil det medføre lammelse fra lænden og ned. Her er grænsen mere tydelig da patienten vil miste føreligheden i den nederste halvdel af kroppen. Patienten vil altså være lam i bækken, ben og fødder og vil derfor have brug for hjælpemidler som f.eks. en kørestol.

I Danmark lever ca. 3000 mennesker med en rygmarvsskade (10-15 per million per år???)
I dette tal er 40\% som følge af traumatiske skader og 60\% som følge af ikke-traumatiske skader. Traumatiske rygmarvsskader dækker over en fysisk skade på rygsøjlen typisk i kraft af ulykker. Ikke traumatiske rygmarvsskader dækker derimod over skader i forbindelse med sygdomme i rygmarven. Hvert år får 130-160 mennesker en rygmarvsskade(indsæt kilde) hvor stort er dette tal i forhold til andet?

På figur \ref{Rygmarv} ses en inddeling af rygsøjlen i forhold til lammelse i kroppen. Det ses at jo højere skaden sidder på rygsøjlen, desto større del af kroppen vil blive lam. 


\begin{figure} [H]
    \centering
    \includegraphics[width=9cm, height=10cm]{Problemanalyse/Billeder/Spinal cord.png}
    \caption{Billedet viser rygmarvens opdeling. De øverste hvirvler, nakkehvirvlerne, navngives med C1-C7. De midterste hvirvler, brysthvirvlerne, navngives som T1-T12. De nederste hvirvler, lændehvirvlerne, navngives som L1-L5. Lammelsen afhænger af hvor skaden på rygmarven sidder. Jo højere skaden sidder, desto større del af kroppen bliver lam.   \cite{https://www.britannica.com/science/vertebral-column}}
    \label{Rygmarv}
\end{figure}


Graden af en rygmarvsskade afhænger ofte af hvor højt på rygsøjlen skaden sidder(indsæt kilde). Som vist på figur x.x vil skaden være mere omfattende jo højere oppe på rygsøjlen skaden er sket. Udover at inddele en rygmarvsskade i hvor højt skaden sidder, inddeler man også skaden i en komplet og inkomplet rygmarvsskade. En komplet rygmarvsskade er når nerverne i rygsøjlen er revet midt over. Når nerverne i rygsøjlen er revet midt over, er der derved ingen forbindelse eller signaler i mellem hjerne og krop via rygmarvskanalen og dette medfører til lammelse i hele kroppen(indsæt kilde). 
En inkomplet rygmarvsskade er når nerverne i rygmarven kun delvist er revet over. Her kan forbindelser og signaler i mellem hjerne og krop stadig foregå, dog i ringere grad og vil derfor resultere i delvis lammelse i kroppen(indsæt kilde). En delvis lammelse kan være svært at definere, da det er en så kompliceret skade som forskere endnu undersøger. (indsæt kilde) \cite{Fakta}
\cite{feher2017quantitative} \cite{ryg} \cite{lillehjerne}\cite{QOL} \cite{Rygmarv} \cite{Stroke} 


Rygmarvsskader er som mange andre brutale skader uhelbredelig, uafhængigt af graden af skaden. Hvis en patient først får en rygmarvsskade vil patienten skulle leve med skaden resten af livet. I dag kan patienter dog få forskellige behandlinger, som skal kunne lindre smerter og eller belastninger i hverdagen. De fleste patienter med en rygmarvsskade sidder i kørestol, dog er der et stigende antal patienter der ved hjælp af behandling kan bevare gangfunktionen i forskellig grad(indsæt kilde). Dog kan patienter efter en rygmarvsskade aldrig hele fuldkommen, men bliver derfor nødt til at gå til hyppig kontrol. Kontrollen finder typisk sted hvert andet år på enten på Afdeling for Rygmarvsskader i Hornbæk eller på Vestdansk Center for Rygmarvsskade i Viborg.(indsæt kilde kontrol). Den hyppige kontrol udføres da patienter kan udvikle andre sygdomme pga. lammelser. Det kan f.eks. være siddesår som sker ved brug af kørestole. Patienter vil blive indkaldt til kontrol resten af livet, og der er derfor meget transport indblandet. Hvis patienterne ikke bor tæt på enten Hornbæk eller Viborg og derfor skal transportere sig henover en længere strækning, kan dette være en gene i hverdagen. (livskvalitet)?


Here is the bibliography

Code: Select all

@book{feher2017quantitative,
  title = {Quantitative Human Physiology: An Introduction},
  author = {Feher, J.J.},
  isbn = {9780128011546},
  series = {Biomedical Engineering},
  url = {https://books.google.dk/books?id=8ALSBgAAQBAJ},
  year = {2017},
  publisher = {Elsevier Science},
}

@misc{Rygmarv,
author = {Michaela Harrow-Mortelliti, Vamsi Reddy,  George Jimsheleishvili.},
  title = {Physiology, Spinal Cord},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK544267/}},
  note= {Accessed 2 Mar 2022},
}

@misc{Fakta,
    author = {Rigshospitalet},
    title = {Fakta om rygmarvsskade},
    year = {2022},
    howpublished = {\url{https://www.rigshospitalet.dk/afdelinger-og-klinikker/neuro/rygmarvsskader/undersogelse-og-behandling/Sider/fakta-om-rygmarvsskade.aspx}},
    note = {Accessed 1 Mar 2022},
}

@misc{Ryg,
author = {Michaela Harrow-Mortelliti, Vamsi Reddy,  George Jimsheleishvili.},
  title = {Physiology, Spinal Cord},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK544267/}},
  note= {Accessed 2 Mar 2022},
}


@misc{Fakta,
author = {Rigshospitalet},
  title = {Fakta om rygmarvsskade},
  year = {2022},
  howpublished ={\url{https://www.rigshospitalet.dk/afdelinger-og-klinikker/neuro/rygmarvsskader/undersogelse-og-behandling/Sider/fakta-om-rygmarvsskade.aspx}},
  note= {Accessed 1 Mar 2022},
}

@misc{Ka,
    author = {RYK},
    title = {Kontrol af rygmarvsskade},
    url  = {http://www.ryk.dk/kontrol},
    addendum = {accessed: 01.03.2022},
}



@book{feher2017quantitative,
  title = {Quantitative Human Physiology: An Introduction},
  author = {Feher, J.J.},
  isbn = {9780128011546},
  series = {Biomedical Engineering},
  url = {https://books.google.dk/books?id=8ALSBgAAQBAJ},
  year = {2017},
  publisher = {Elsevier Science},
}

@online{typer,
    author = {Hjerneskade foreningen},
    title = {Aersager til hjerneskade},
    url  = {https://hjerneskadet.dk/viden-om-hjerneskade/aarsager-til-hjerneskade/},
    addendum = {accessed: 08.03.2022},
}

@online{motorstroke,
    author = {Flint Rehab},
    title = {Stroke in the Motor Cortex: What to Expect & How to Recover},
    url  = {https://www.flintrehab.com/stroke-in-the-motor-cortex/},
    addendum = {accessed: 08.03.2022},
}

@online{lillehjerne,
    author = {Kiara Anthonyb},
    title = {Cerebellar Stroke},
    url  = {https://www.healthline.com/health/cerebellar-stroke},
    addendum = {accessed: 08.03.2022},
}
@misc{Strokesyndrome,
  author = {J.S. Balami, R.L. Chen, A.M. Buchan},
  title = {Stroke syndromes and clinical management},
  year = {2013},
  howpublished ={\url{https://academic.oup.com/qjmed/article/106/7/607/1591567#23291350},
  note= {Accessed 8 Mar 2022},
 {
  
 @article{brainstemstroke,
title = {Brainstem Stroke: Anatomy, Clinical and Radiological Findings},
journal = {Seminars in Ultrasound, CT and MRI},
volume = {34},
number = {2},
pages = {131-141},
year = {2013},
issn = {0887-2171},
doi = {https://doi.org/10.1053/j.sult.2013.01.004},
url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S088721711300005X},
author = {Ana Ortiz {de Mendivil} and Andrea Alcalá-Galiano and Marta Ochoa and Elena Salvador and José M. Millán},

}

@article{QOL,
title = {Components of quality of life for persons with a quadriplegic and paraplegic spinal cord injury},
doi = {10.1177/104973201129119541},
url = {https://www.researchgate.net/publication/11645197_Components_of_Quality_of_Life_for_Persons_with_a_Quadriplegic_and_Paraplegic_Spinal_Cord_Injury},
year= {2001},
author = {Patricia J. Manns,Karen E. Chad},
}

@article{SF-36,
title = {Quality of life and traumatic spinal cord injury},
doi = {10.1016/s0003-9993(98)90240-4},
url = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003999398902404},
year= {1998},
author = {Ninni Westgren,Richard Levi},
}
Last edited by Stefan Kottwitz on Tue Mar 15, 2022 2:49 pm, edited 1 time in total.
Reason: code marked
User avatar
Stefan Kottwitz
Site Admin
Posts: 10348
Joined: Mon Mar 10, 2008 9:44 pm

Some of my sources are showing up as question marks

Post by Stefan Kottwitz »

There are several issues in the bibliography file.

There are closing braces missing (such as when there are \url entries), the Strokesyndrome ends with { instead of a closing brace }, there are repeated entries, for example feher2017quantitative and Fakta are doubled, the brainstemstroke entry has an empty line, \cite{Stroke} refers to an entry that doesn't exist.

When you run BibTeX, look at the console output or inspect the .blg file for errors.

Stefan
LaTeX.org admin
ST26AAUDK
Posts: 3
Joined: Fri Mar 11, 2022 11:40 am

Some of my sources are showing up as question marks

Post by ST26AAUDK »

I have been playing with the project and noticed that something strange. Sources that are in the first file that I have included in master.tex appear as they should, but they don't work in the other files. I have copied the exact same text (shown below) into the first file and the source works there, but doesn't work if it's in the second included file.

\chapter{Skader på Centralnervesystemet}

\section{Skader på rygmarven}
Som beskrevet tidligere består rygsøjlen af 33 knoglehvirvler, men i forhold til en rygmarvsskade er der fokus på de øverste 24 knoglehvirvler. Disse knoglehvirvler udgør en sund og rask rygsøjle. De øverste 24 knoglehvirvler inddeles altså i nakke-, bryst- og lændehvirvlerne. Disse knoglehvirvler fungerer også som en beskyttelse for nervebanerne der løber fra hjernen og igennem rygmarven. En rygmarvsskade er en eller flere skader på disse nerver i rygmarvskanalen, som er grundelementet for forbindelser og signaler mellem hjerne og krop.

\subsubsection{Primæreskader}


\subsubsection{Sekundæreskader}

Hvis en rygmarvsskade sker på nakkehvirvlerne, altså på en eller flere af C1-C7-hvirvlerne, vil det medføre total lammelse i kroppen. Dog vil der være få bevaret motoriske funktioner, såsom øje- og talefunktion.
En total lammelse rammer ikke patientens psykiske hjernefunktion. Det betyder altså, at lammelsen kun går ud over de motoriske evner i kroppen. I værste tilfælde kan en total lammelse også ramme hals- og talefunktionen, så patienten kun kan bevæge øjnene.\cite{Fakta}


Any ideas why that might be?
Post Reply